Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9H8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9H8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9H8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms