Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg7Q9D906 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg7Q9D906 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms