Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc91Q9D8L5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc91Q9D8L5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms