Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmem54Q9D7S1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem54Q9D7S1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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