Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clic3Q9D7P7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clic3Q9D7P7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms