Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Capns2Q9D7J7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capns2Q9D7J7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms