Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsraQ9D6Y7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MsraQ9D6Y7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms