Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab11fip1Q9D620 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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