Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer4f1Q9D5Q6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms