Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn11Q9D572 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn11Q9D572 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms