Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930513O06RikQ9D549 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms