Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc105Q9D4K7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc105Q9D4K7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms