Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931423N10RikQ9D4J9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms