Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhd1Q9D4J1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms