Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam90a1bQ9D4F3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam90a1bQ9D4F3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms