Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clvs1Q9D4C9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms