Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms