Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efhc2Q9D485 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms