Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D454 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D454 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D454 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms