Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms