Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms