Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnal2Q9D3R6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnal2Q9D3R6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms