Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrnp35Q9D384 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms