Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed11Q9D2R4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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