Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D2Q3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms