Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D930007J09RikQ9D2K6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms