Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms