Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Susd3Q9D176 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms