Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem53Q9D0Z3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms