Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm12Q9D0R8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms