Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mdm1Q9D067 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms