Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Raet1eQ9CZQ6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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