Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc77Q9CZH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc77Q9CZH8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc77Q9CZH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc77Q9CZH8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc77Q9CZH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc77Q9CZH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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