Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klhl35Q9CZ49 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl35Q9CZ49 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms