Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snf8Q9CZ28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snf8Q9CZ28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms