Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms