Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms