Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm8Q9CXT6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kdm8Q9CXT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms