Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo1Q9CXH7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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