Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RpainQ9CWY9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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