Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkrip1Q9CWV6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms