Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn3Q9CVD2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms