Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2310003L06RikQ9CV82 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms