Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Otud1Q9CUB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms