Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms