Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a2Q9CTG6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms