Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snw1Q9CSN1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms