Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931417E11RikQ9CR05 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms