Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tma16Q9CR02 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms