Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PompQ9CQT5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms